O vytváření dobrého ovzduší se stará standardní komfortní automatická dvouzónová klimatizace THERMATIC. K dispozici je též volitelná komfortní třízónová automatická klimatizace.

Pomocí volitelné luxusní automatické třízónové klimatizace THERMOTRONIC můžete přesně definovat ovzduší v interiéru vozu GLK – samostatně pro přední a zadní prostor, jakož i pro řidiče a spolujezdce. Klimatizace THERMOTRONIC automaticky reguluje teplotu, otáčky ventilátorů a rozdělení vzduchu. Systém též bere v úvahu faktory, jako je cestovní rychlost, venkovní teplota, sluneční záření a kvalita vzduchu, aby se co nejvíce snížily požadavky na chlazení – a špatný vzduch zůstal mimo vozidlo.